当公司申请破产时，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
及时申请劳动仲裁
员工在得知公司破产后，应尽快向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求支付经济补偿金或赔偿金。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条和第四十六条的规定，用人单位被依法宣告破产的，劳动合同终止，员工有权要求支付经济补偿金。如果公司在破产前存在违法解除或终止劳动合同的情形，员工还可以要求支付赔偿金，赔偿金的标准为经济补偿金的两倍。
参与破产程序
员工可以作为债权人参与破产程序，了解破产财产的分配情况，确保自己的权益得到保障。在破产清算程序中，员工需配合相关部门对债权进行申报。在重整或和解程序中，员工也应关注公司的后续发展情况，以争取更好的解决方案。
寻求法律援助
如果员工在维权过程中遇到困难，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自身权益。律师可以帮助员工准备相关证据，提供法律咨询，并在必要时代表员工进行谈判或诉讼。
关注安置措施
部分破产公司可能会制定安置方案，为职工提供再就业培训、转岗等安排。职工应积极关注公司的安置措施，根据自身情况选择合适的出路。
了解自身权益
员工应了解自己在破产程序中所享有的权利和应履行的义务。例如，根据《企业破产法》第一百一十三条的规定，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，首先清偿职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用等。
保持沟通
员工可以通过工会等组织与公司进行沟通协商，了解破产程序的进展以及自身权益的保障情况。同时，员工也可以关注相关法律法规的规定，确保自己的权益得到最大程度的保障。
总之，公司申请破产后，员工应保持冷静，积极采取措施维护自身权益，通过合法途径争取应得的补偿和安置。在破产程序中，员工应积极参与并了解自己的权益，以确保最终能够获得应有的经济补偿和安置。
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