水利企业应纳税额的计算涉及多个税种，具体计算方式如下：增值税增值税一般纳税人按其销售收入扣除进项税额后的余额计算应纳税额。企业所得税根据企业的年度利润总额，按照法定税率（通常为25%）计算。水利基金水利基金按经营收入的千分之一缴纳。城建税城建税应纳税额 = （增值税 + 消费税） × 适用税率，税率
